胎儿生长发育迟缓的病因复杂，可能与胎盘、脐带异常，母体因素，胎儿自身因素有关，好发于孕期有不良嗜好者。
1、胎盘、脐带异常：胎盘供血异常、脐带绕颈等情况易造成胎儿宫内缺血，影响胎儿生长发育。
2、母体因素：胎儿体重与孕妇身高、孕前体重、妊娠时年龄等因素相关，如孕前体重低于54kg，妊娠时体重过小或过大，发生胎儿宫内发育迟缓机会均增高。此外，影响子宫和胎盘血流灌注的妊娠并发症，如妊娠期高血压疾病、妊娠合并肾疾病、严重贫血、严重营养不良、长期低氧血症等疾病也可能导致胎儿生长发育迟缓。
3、胎儿自身的因素：胎儿的基因以及染色体异常，如21三体综合征、18三体综合征，胎儿在母体内感染风疹病毒、单纯疱疹病毒等，均可能导致胎儿宫内发育迟缓。