治疗重症肌无力的医院可以选择一些综合性大型医院或专业性的神经内科医院。以下是一些国内比较知名的医院推荐：
1. 北京协和医院神经内科：重症肌无力诊疗中心
2. 复旦大学附属华山医院神经内科：神经免疫科
3. 上海交通大学医学院附属瑞金医院神经内科：神经免疫科
4. 中国医学科学院北京协和医院神经内科：神经免疫科
5. 上海市中山医院神经内科：神经免疫科
6. 浙江大学医学院附属第一医院神经内科：重症肌无力中心
请注意，以上仅为参考，具体选择还需结合病情、地理位置等因素进行评估。