一般情况下，肛门长肉球、疼可能是肛周脓肿、血栓性外痔等原因引起的。具体分析如下：
1.肛周脓肿：如果患者肛门受到细菌感染，容易引起炎症，受到炎症刺激，可能会形成脓肿，导致肛周脓肿，从而引起肛门长肉球、疼。
2.血栓性外痔：如果患者长期便秘，可能会使粪便不易排空，容易对直肠下段和肛管部位产生比较大压力，可能会发生曲张，导致血栓性外痔，使肛门长出暗紫色的卵圆形肿物，从而引起肛门长肉球、疼。