可影响呼吸，进食，说话等日常的活动。也可以继发感染，表现出局部红肿疼痛，或者破溃后形成甲状舌管瘘，一旦发现甲状舌管囊肿，应该进行手术，将甲状舌管囊肿及部分舌骨一并完整切除。如果合并有感染，应该首先控制感染之后，再进行手术治疗，手术后需要常规进行病理检查。