羊肚菌中含有多种微量元素、维生素等营养成分，有抗菌、抗病毒的功效，还含有抗氧化剂硒元素等，经常食用，能够抗病毒、缓解疲劳，提高机体免疫力，还可以防癌抗癌，减少和消除致癌的危险。中医认为，羊肚菌具有健胃消食，补肾壮阳的功效，可以治疗脾胃虚弱、消化不良、失眠头晕等病症。羊肚菌是动风食物，过敏者不宜食用。