酵素的副作用会导致人体的疲劳乏力，皮肤粗糙，头晕目眩，睡眠质量低，严重的还会造成脑血栓，半身不遂，脑梗等。危害有，自制酵素发酵环境的温度是比较适宜微生物繁殖的，制作不成功，会产生一些杂菌和有害物质，会引起食物中毒。果胶经过微生物发酵之后，会产生甲醇。在家中自制酵素，酵素能帮助降低血液中胆固醇和脂肪含量抑制血小板凝聚功能，恢复血管弹性。所谓的酵素副作用与危害性大多是自制酵素。