针对结核分枝杆菌有显著的抑菌和杀菌作用。针对结核病的治疗，效果是不错的，一般常常与其他抗结核药物联合使用。而链霉素也可以用于治疗鼠疫，效果也是不错的，以及还可以治疗阴沟肠杆菌所导致的心内膜炎。链霉素的副作用要注意，最常见的是耳毒性，因为链霉素会在耳内蓄积，损害前庭神经和耳蜗神经，所以要用药的时候要注意的剂量和用药时间。