肝囊肿正常是没有特别大的危害，平时所发现的大部分都是单纯性肝囊肿，正常不会癌变，也不影响肝功能等情况，只是较大的外生性肝囊肿，可能会压迫周围的胃肠道，导致有消化道梗阻的症状。少数情况下肝囊肿可合并感染。另一种发现的肝囊肿是多囊肝合并多囊肾，这是一种先天性疾病，肝囊肿会进行性加重，进而使肝脏实质越来越少，严重影响肝脏功能，最终可能会使肝脏功能衰竭。