长期吃酵素的好处有调节肠道菌群的功效，具有润肠通便，治疗便秘的功效。还可以消除疲劳，提高机体免疫力，促进消化。可以治疗脘腹胀满，治疗慢性腹泻等病症。服用酵素时，要清淡饮食，多吃营养易消化的食物，不要进食油腻性较大的食物和高胆固醇食物。