甲流引起咳嗽咽痛可以服用止咳的药物进行治疗，同时可以适当吃些润肺的食物，来缓解不适。
中医认为，出现咽痛、咳嗽的症状，是由于患者感受热毒之邪，热毒袭肺上溢喉咙，引发局部疼痛。当病邪侵入肺脏，郁而化热，热伤肺津，炼液成痰，痰热壅塞于肺，引起肺失清肃，肺气上逆会出现咳嗽。在治疗上，应以清肺泄热为主，如连花清咳片。该药具有宣肺泄热、化痰止咳的功效，方中半夏、浙贝母、前胡、陈皮化痰顺气；桑白皮、黄芩、生石膏清肺泻热，辅以大黄通腑泻肺；山银花、连翘、牛蒡子辛凉清解、透热达表；麻黄、炒苦杏仁、桔梗宣畅肺气，诸药和之起到宣发在肺之邪、肃降上逆之气的作用，所以对于甲流引起的咳嗽、咽痛症状，有很好的治疗效果。
除服用药物外，患者应避免食用辛辣刺激或油炸类的食物，以免加重对咽喉的刺激，导致咳嗽、咽痛加重。