脚小指头疼考虑到可能是因为外伤、骨赘和类风湿关节炎造成的，外伤可以用云南白药治疗，骨赘可以用氯诺昔康片治疗，类风湿关节炎可以用硫酸羟氯喹片治疗，如果病情严重的情况下，要及时到医院就诊，并在医生指导下对症治疗:
1、外伤：当脚小指头损伤时，脚趾肌腱受损，严重者会发生骨关节断裂、变形，使脚趾屈曲，造成脚趾扭曲。穿着不合脚的鞋，会让脚长时间受挤压而导致脚趾弯曲，还会有脚小指头痛。伤后24小时局部冰敷以缓解水肿,24小时后热敷以化瘀。
2、骨赘：由于关节退变或关节不稳引起的脚小拇指及软骨周围骨赘、关节软组织和血管受压而发生骨赘，会有脚小指头的疼痛，也有可能关节活动受限，疼痛麻木。一般可以在医生指导下用氯诺昔康片，塞来昔布胶囊，阿司匹林肠溶片。
3、类风湿关节炎：主要侵蚀手足小关节，可引起逐渐关节部位出现明显肿胀，疼痛。类风湿关节炎对脚关节健康有影响，造成关节变形或者脚小指头酸痛等。风湿性关节炎属于自身免疫性疾病，可以在医生的指导下服用甲氨蝶呤片、硫酸羟氯喹片、美洛昔康片等药物。