酸枣仁的不良反应有情绪异常、乏力、恶心等，部分患者还可能会出现病情加重的问题。
有些人吃了之后会出现情绪激动、乏力等症状。有过敏体质或有药物过敏史的人，不能吃酸枣仁，以免引起过敏。有一些高血脂、心脏病、糖尿病、高血压等疾病的患者不宜使用，否则会导致病情恶化。
如果有肾功能不全或者是有脑血管疾病的人，最好不要吃。大量饮酒和抽烟的人若服食，极易产生种种不良反应。怀孕期间不建议饮用酸枣仁水，以免造成流产的问题。