临床一般不宜自行进行肛门指检，因其缺乏专业医学知识而难以辨别局部病变情况，相反可导致黏膜损伤。建议如果自觉肛肠不舒服，需及时就诊，请专业医生检查以确定病因，并在医生指导下规范处理。
一般不宜自行做肛门指检由于指肛检查以肛门直肠周围有无痔疮、息肉、肿瘤及其他病灶为主，尽管比较简单，但是还需正规医院医生做。而自己指检又分不清是粪还是肿，对局部肛门内部结构还不清楚，对组织有无病变还不能清楚，对疾病的判断还不够充分，不免使自己惶惶不可终日。
另外，如果自己检查时动作不柔和，可能会损伤肠道中黏膜组织。故临床上不宜自肛门指检。建议在平时要注意清淡饮食、多饮水、忌食辛辣刺激性食品，有助于降低肛肠疾病发病率。还要注意适当的运动，刺激胃肠蠕动对健康有好处。