婴儿肛周脓肿初期症状主要是哭闹，接触肛门或排便时哭闹加重。随着脓肿形成，可以见到肛周红色肿块，起初肿块质硬，逐渐肿块中间变软破溃溢脓，形成肛瘘，这时患儿哭闹减少，破溃口会反复溢脓。婴儿肛周脓肿大多发生于腹泻患儿，形成脓肿时间较短，2-3天可以见到肿块。