肛瘘手术至少需要2个月以上的时间，切口才能完全愈合。手术是将瘘管切开或者切除，然后形成敞开的创面，同时会利用橡皮筋给予肛门括约肌进行挂线。由于肛周创口敞开以及括约肌挂线术后恢复相对比较慢，肛门需要排便，肛周经常处于污染的环境，所以创口的愈合要比正常其他部位的切口愈合要慢。