低位肛瘘在门诊即可解决，其综合费用在三千元左右；复杂肛瘘若需住院，费用在一万元左右；肛瘘一旦形成，手术是治疗高位肛瘘的方法；但手术中过度损伤肛直环会导致不可逆的肛门损伤及造成一系列的心理和经济负担，因此手术要充分保护肛门的核心结构“肛直环”；目前常用的手术方式主要分为括约肌保留术式和括约肌切断术式两大方向。