导致肛门疼痛最常见的原因就是肛裂，便秘是主要的诱发因素，因为每次排便的时候，会导致肛门裂口的出现，并且也容易诱发局部感染，反复的发作形成溃疡面和瘢痕。血栓性外痔以及肛周脓肿的病人也有明显的肛门疼痛，都属于肛周的常见的良性疾病。而肛管的恶性肿瘤也会导致肛门出现疼痛，平时也要注意局部卫生，定期进行检查。