肛肠疾病较多，通常分大肠疾病和肛周直肠疾病两大类。大肠疾病常见有，大肠息肉、大肠癌、溃疡性结肠炎，慢性结肠炎，出血性肠炎，缺血性肠炎，结肠憩室，大便黑病变等。肛门直肠周围疾病常见有，痔疮、肛裂、肛门脓肿、肛瘘、肛窦炎、直肠息肉、直肠癌、肛管乳头状瘤、肛管癌、肛门湿疹、以及尖锐湿疣等性传播疾病等。