目前临床上肠镜分结肠镜与小肠镜。通过安装在肠镜前端的电子摄像探头将肠道粘膜的图片传输于电子计算机处理器中心，后显示在监视器屏幕上。通常所说的肠镜检查为结肠镜检查，就是对于大肠的检查。用一根电子纤维镜通过肛门插入逆行向上检查，观察直肠、乙状结肠、降结肠、横结肠、升结肠、盲肠和部分小肠的观察。可观察到肠粘膜的微小病变。