如果只是单纯的行胃肠镜检查，没有行内镜下治疗，胃镜的检查时间大概是5-10分钟。肠镜的检查时间大概在20-30分钟左右，因此整体检查的时间一般不超过1小时。当然这和被检查者肠道形态有无异常，以及内镜医师熟练度有关。而如果在肠镜检查的过程中发现异常，需要同时行内镜下处理，操作时间会相应的延长。