肛窦炎大多采用中药灌肠和口服药物相结合的方法治疗，不要自己乱用药物，否则可能会造成肠道菌群失调，肛门肿胀疼痛，可以进行相应的辅助检查进行确诊，如果单纯性的炎症没有造成功能性的障碍，可以局部进行热敷，或者是选择药物熏蒸，还应该保持大便的通畅，预防便秘，预防出现局部压力过大，引起的组织粘膜肿胀。