治疗肛瘘需要通过肛瘘切开挂线术，手术过程一般是在保护肛门括约肌功能的前提下尽量将瘘管壁以及内口外口处理干净。手术中肛门局部形成皮筋的挂线，术后随着皮筋的脱落，表明局部括约肌间断性的切割。皮筋脱落以后表明局部伤口基本恢复，还需要后期生长肉芽。