大多数肛周脓肿起源于肛腺导管的阻塞伴细菌繁殖和脓肿形成，缺乏波动感时应延迟引流。治疗应包括脓肿的切开引流和防止切口假愈合而导致急性复发。切口宜适当，置管引流或挂线。肛瘘术前常用挂线控制局部感染。很多肛周脓肿在门诊容易治疗，但复杂性感染需在麻醉下检查以确保适当引流。