肛瘘反复发作会对肛管直肠周围的组织造成严重损伤，肛门就无法对稀便进行控制，导致了肛门失禁情况的发生。肛门直肠受到炎症的反复刺激还会引发瘢痕挛缩，病人还会出现排便困难等现象，严重会有恶心、呕吐、肠梗阻等病症发生。人体免疫力就会因此降低，会增加肛瘘癌变的几率，而且病人还会经常出现便血等症状。