首先术前准备：各种必要的化验检查，调整饮食，少渣食物。术前清洁肠道。然后再是手术过程麻醉：局部浸润麻醉或骶管麻醉，目的：止痛、松弛肛门。用探针经肛瘘外口沿瘘道探寻内口，此过程是关键。如果是直瘘，则将内口、瘘道及外口完整切除，止血、包扎，手术完毕。