肛瘘通常需要手术，因为如果不治疗很少会自行愈合。常见的手术方法包括：瘘管切开术包括切开瘘管的整个长度，使其愈合成扁平瘢痕。挂线术：将一条外科线放置在瘘管中并放置数周以帮助它愈合，然后再进行进一步的治疗。其他技术-包括用特殊的胶水填充瘘管，用特殊的材料封堵等，手术后通常需要住院治疗一到两周的时间。