肛周脓肿不同于一般外科感染性脓肿，如体表的疖肿、蜂窝组织炎等，肛周脓肿是因为细菌感染后化脓形成的。引起肛周脓肿的病因较多，主要原因有肛门腺感染：肛门腺开口于肛管直肠交界处的肛窦内，肛窦呈漏斗状向上开口，易损伤及细菌的侵入而引起感染，全身抵抗力减弱。