肝门淋巴结肿的原因比较多，包括肝炎、胆管炎、结核感染等。
1、肝炎：某些病原体，如乙型肝炎病毒侵入肝脏，肝包虫随血流进入肝脏，或长期服用阿司匹林、消炎痛等肝毒性药物，酒精性肝炎，当肝炎发作时，肝门淋巴结分泌大量免疫细胞，参与炎症反应，引起肝门淋巴结肿大。
2、胆管炎：胆道阻塞或胆囊发炎可继发于胆管炎，胆管与肝管相通，当胆管炎发生上行感染时，可扩散至肝门，造成淋巴结肿大；
3、结核感染：结核分枝杆菌感染肝脏后，不仅引起肝内炎症反应，还可随淋巴液侵及肝门淋巴结，两者结合，可引起淋巴结肿大。