感冒引起肌肉酸痛临床常用的治疗药物有连花清瘟胶囊等，该药对普通感冒、流感所引起的肌肉酸痛、发热或高热、恶寒、鼻塞、流涕、头痛、咽干咽痛等症状有效。而且它还具有广谱抗病毒、抑菌抗炎、调节免疫的现代药理作用，有利于较好控制普通感冒和流感的病情进展、缩短病程。
此外，若因细菌感染引起的感冒，出现肌肉酸痛等症状，可考虑服用抗生素类治疗药物；若是因流感病毒感染引起的流行性感冒，出现肌肉酸痛等症状，可以在医生指导下选择抗病毒类药物进行治疗。