对于患有宫颈糜烂的女性，在做妇科HPV检查时，使用小毛刷清洁宫颈分泌物可能会引起疼痛不适。这是因为宫颈表面由于炎症或感染等因素已经变得脆弱，清洁过程中容易出现损伤，导致疼痛和不适感。但是，通常情况下，这种疼痛较轻且短暂，女性可以忍受。
为了减轻宫颈疼痛和不适感，建议女性在检查前尽量避免性生活，保持放松状态，同时注意阴道清洁。如果女性在检查后出现疼痛、出血等症状，建议及时就医并遵医嘱服用药物。