妇女怀孕初期孕酮偏低，可能为黄体功能不健全或胚胎质量差引起先兆流产甚至自然流产。
若此时尚未查彩超诊断为宫内孕时，孕酮较低，特别低于15.9ng·ml-1,则应考虑为宫外孕概率较大。由于受精卵着床于宫腔外其他部位，因着床部位营养环境较差，故hcg及孕激素水平往往较低。这时需要进保胎治疗，或者进行引产，可以起到保护身体的效果。