右侧附件的囊肿会不会影响到怀孕，要看囊肿的大小和病变的严重程度，如果是恶性病变，或者是囊肿较大，都要及时处理，如果已经怀孕了，要立即终止妊娠，并对原发病进行治疗。
如果是在怀孕后发生的疾病，而且病灶不大，也可以继续怀孕，不过需要密切关注疾病的发展。在没有怀孕的时候，就已经有了这样的症状，要尽快的对症治疗，等到症状彻底消失后，才能考虑是否要怀孕。