输尿管结石手术通常有体外冲击波碎石术、输尿管软镜钬激光碎石或经皮肾镜超声碎石清石术等。
输尿管结石的处理方法与结石的位置、大小有关。例如，对于刚从肾盂进入输尿管的输尿管上段结石，可以进行3周的体外冲击波碎石。在结石未发生移位的情况下，可以采用输尿管软镜钬激光碎石或者经皮肾镜超声碎石清石术。如果是输尿管内中下段的结石，在体外碎石不成功的情况下，还可以通过输尿管硬镜和钬激光碎石来进行治疗。