由于一些遗传疾病，通过第三代IVF可以提前确定性别。第三代IVF也被称为胚胎前基因检查，简称PGD。该技术适用于遗传病、复发流产、染色体异常等
。一些基因疾病和性别相关，只能出现在男女之间，比如血友病只能出现在男童中，因此这些患者在进行IVF之前，都会选择只接受雌性的胚胎。第三代体外受精需要更多的时间和更多的钱。第一、第二代IVF是没有性别选择性的。