怀孕期间做亲子鉴定有两种方法，一种是传统的选择羊水，作为样本，一般要在怀孕至少13～16周之间，取得胎儿绒毛作为样本。或者是在16～24周之间，做羊膜腔穿刺，取得胎儿羊水样本。还有一种方法，比较先进，在怀孕七周以上，选择孕妇的静脉血来作为比对样本。羊膜腔穿刺获取样本，需要从阴道穿刺获取，所以必须严密消毒，需要医生来操作，静脉血样本可以自己获取，也可以去医院，由医生帮助采血。通常这种亲子鉴定具有私密性，所以不要求对方必须到场。