由于引起附件囊肿的原因不同，所以是否会自动消失，这要因人而异。如果是卵子排出后，卵泡内液体积聚而形成的黄体囊肿，通常都会自动消失，而且这类囊肿一般比较小，对女性的身体不会造成不良影响。如果是高水平雌激素刺激导致的附件囊肿，或者是子宫内膜异位到卵巢形成的巧克力囊肿，通常是不会自动消失，而需要行手术才能彻底消除。