对于绝大部分子宫内膜异位症患者，其最佳的治疗都是以手术切除为主，可能需要将内膜异位灶直接切除，也可能需要将整个子宫切除。在手术切除以后还需要将组织送病理检查，来确诊是否是子宫内膜异位症。其病理报告多在手术后一周出来，主要是看病理报告的结论描述，一般会直接写出查到有子宫内膜组织。如果是子宫腺肌症的女性，则在子宫肌肉层也会发现子宫内膜。