如果在体检当中发现有卵巢囊肿，可以通过以下几种方法来区分是生理性的和病理性的：1.如果附件区的囊肿是单侧，并且体积比较小，在5厘米以下，在月经干净以后复查往往就会消失，这就属于生理性的。2.另外可以通过B超影像学来初步判断是生理性还是病理性囊肿，生理性的囊肿壁光滑，囊肿里面是液性暗区，而病理性的囊肿，可以表现为囊实性，或者是双侧囊肿，壁比较粗糙。3.还可以通过抽血化验肿瘤标志物来判断是生理性还是病理性囊肿。