患有左侧卵巢囊肿怀孕了是不影响胎儿的。但是如果卵巢囊肿大于5厘米，容易因为体位变化导致卵巢囊肿蒂扭转，发生急性腹疼，严重时会导致卵巢坏死，影响卵巢功能，患者需要行急症手术，严重会导致流产或者先兆性流产。所以术前最好检查一下卵巢囊肿大小，如果卵巢囊肿大于5cm，最好行卵巢囊肿剥除术然后再要孩子，如果卵巢囊肿小于5cm，考虑是生理性的囊肿，不用治疗。