左侧卵巢囊肿会影响左侧卵巢排卵的。因为正常有两个卵巢，所以一般是不影响另一侧卵巢排卵的，也是可以怀孕的，不过是相对于两侧卵巢排卵怀孕几率会减小。但是如果卵巢囊肿小于5cm，一般也不影响排卵，如果囊肿大于5cm，卵巢囊肿占据了卵巢比较大的面积，会影响排卵。所以有大于5cm的囊肿，一般建议进行手术治疗，可行卵巢囊肿剥除术，能增加排卵几率，提高妊娠机会。