如果做B超发现有5厘米的卵巢囊肿，不算是很大，不过也有可能会发生一些并发症，比如扭转、破裂或者感染等。如果之前没有发现过这种情况，可以在月经干净以后再复查一下B超。如果消失了，说明这是生理性的黄体囊肿，不用治疗。但是如果仍然比较大，需要进行手术治疗。可以采取腹腔镜手术，创伤比较小，手术后身体恢复的也比较快。