自然流产肚子疼得厉害是正常的。一般自然流产后会出现轻微的腹痛，这是因为子宫需要通过收缩恢复到怀孕前的状态导致的，一般来说这种疼痛和痛经相似，并且持续几天疼痛就会缓解。如果腹痛程度比较重，那么需要警惕是否存在不全流产，宫腔内有残留物会导致出现腹痛，并且程度重，持续时间长，这种情况需要尽快进行清宫手术。另外还可能是宫腔感染引起的，患者需要进行抗炎治疗。