卵巢囊肿手术危害并不是很大，一般认为其利大于弊。卵巢囊肿分为生理性的和病理性的，一般是因为炎症和内分泌失调因为的。左侧卵巢囊肿如果超过5cm，并且引起左侧下腹部胀痛或在月经不规律。手术后如果不注意，有以下危害：1.术后不注意卫生，会引起感染，导致阴道不规则出血、阴道排液，白带异常，腥味或者是恶臭味，严重这可以引起下腹部包块、发热的症状。2.如果患者手术后不调理月经，因为内分泌失调可能会出现囊肿复发，而进行二次手术。3.毕竟是一种盆腔内操作，卵巢囊肿剥离就会影响卵巢自身的功能，术后会出现盆腔粘连等疾病，影响怀孕。