卵巢囊肿手术都是很安全的，没有什么并发症。个别人可能会出现切口感染、脂肪液化、肠粘连、褥疮、坠积性肺炎、深静脉血栓、一侧卵巢功能下降，甚至可能会增加宫外孕或不孕症的发生率。卵巢囊肿很小不需要手术，大的卵巢囊肿容易出现囊肿蒂扭转、破裂、感染，甚至恶变等可能，需要考虑腹腔镜或手术切除，手术后需要病理检查排除恶性的可能。