腹腔镜手术治疗巧克力囊肿手术，如果术中一切顺利，手术操作的时间大致在一个小时左右。如果手术存在困难，比如盆腔粘连的情况下，手术的时间也相应的延长。腹腔镜手术属于微创手术，对身体损害性小恢复的比较快，手术之后切除的组织部还需要做病理检查明确诊断的，如果确定是子宫内膜异位而导致的巧克力囊肿，术后还需要肌注亮丙瑞林或者戈舍瑞林注射液，3个月到半年的时间，这样可使残留的病灶坏死，降低子宫内膜异位症的发生率。