在市级大医院，输尿管结石微创手术一般是在全麻下进行的，是没有疼痛感觉的。在基层医院，这种手术常常是在半身麻醉下进行，如果结石位置较高，麻醉平面可能无法达不到结石位置，术中可能会有腰酸不适症状，但多数是能够耐受的。而术后，等麻醉效果消失后，患者可能会有手术部分酸胀不适症状，这主要是由于输尿管内留置支架管引起的，等一两天后患者就会适应这种感觉的。