输尿管结石腰部仍然有疼痛，考虑应该是结石没有完全排出所引起的现象。因为如果输尿管结石完全排出体外，输尿管内没有结石刺激，患者不会有疼痛、不适的表现。
如果输尿管结石没有完全排出体外，则这时输尿管结石会刺激输尿管黏膜引起输尿管痉挛，从而使输尿管结石以上的肾盂、输尿管压力增加牵扯输尿管的神经，而出现腰部疼痛、不适，并且向下腹部放射。