念慈庵止咳糖浆是一种中成药，在孕期是建议慎用的。在孕12周以内，尽量避免使用对胚胎有害的药物。如果咳嗽很严重的话，可以口服抗生素，可以口服抗病毒颗粒。具体的最好去医院做相关的检查，比如血常规C反应蛋白的检查，来判断是细菌感染或者病毒感染，以便很好地使用药物。但是在孕期最主要是大量喝水，注意进食含维生素C丰富的水果及蔬菜，这有利于提高身体的抵抗力，预防感染的发生。