怀孕期间，孕妇血清中甲型胎儿蛋白主要来自于胎儿。妊娠期间甲型胎儿蛋白可能具有糖蛋白的免疫调节功能，可预防胎儿被母体排斥。胎儿体内的甲胎蛋白在妊娠6周快速升高，至妊娠13周达高峰，此后随妊娠进展逐渐下降至足月。孕妇体内的甲型胎儿蛋白来源于羊水和胎血，但与羊水和胎血变化趋势并不一致。妊娠早期，母体内甲型胎儿蛋白浓度最低，随妊娠进展而逐渐升高，妊娠28-32周时达高峰，以后又下降。孕期甲型胎儿蛋白浓度越低，说明胎儿患有唐氏综合征的风险越高（需要综合分析）；甲型胎儿蛋白偏高，也是一种异常现象，需要进一步检查明确具体原因。