通常情况下，口腔溃疡患者首选局部药物治疗，如果症状严重，可遵医嘱配合口服药调理。
局部药通常是贴片、含漱液、含片等剂型，比如意可贴醋酸地塞米松口腔贴片，该药物抗炎抑菌效果较好，贴敷在患处可于短时间内发挥药效，五分钟左右可见疼痛缓解，药效持续可达三小时左右。口腔溃疡症状普通的患者，使用贴片一天左右即可见溃疡逐渐愈合。不过需注意，如果患者的症状比较严重，还可以配合牛黄解毒片、复方氯已定含漱液等药物治疗，可以促进疼痛、炎症的进一步消退。
为预防口腔溃疡加重或复发，患者应注意控制饮食、作息、免疫等诱发因素，如果是因免疫低下所致溃疡，此时可联合使用维生素C片、B族维生素片等补剂治疗，这类营养元素的补充可帮助改善细胞及体液免疫能力，利于促进口腔溃疡的自我修复，帮助缩短溃疡病程。